三峡库区生态环境与生物资源省部共建国家重点实验室培育基地于2010年经科技部批准立项建设。实验室以“三峡库区生态环境保护与修复、生物资源保护与开发应用的基础和应用基础研究基地、三峡库区可持续发展的决策和咨询智库”为总体定位，从三峡库区的水质演变及预警、鱼类资源及其保护利用、陆地生态系统结构与功能、岩溶环境与山地灾害四个方向开展研究工作。现任实验室主任为王志坚教授，副主任为曾波教授和李航教授。

实验室现有固定人员62名，其中教授46名，53人具有博士学位。包括中科院院士1人、973首席科学家1人、“国家级人才”7名、“国家级青年人才”4名、“重庆市级人才”4人。

目前，实验室在研项目120项，包括973、863、国家重点研发项目以及国家自然基金项目等国家级项目64项，在研项目合同经费达1.24亿。实验室开始建设以来，在immunity、Leukemia、Nanoscale、Endocrinology、Developmental Cell、Gastroenterology、Journal of Cell Biology、Journal of Virology、Chemical Communications、Analyst、Journal of cellular biochemistry、Plos One、Aquaculture、Journal of Fish Biology等多种国际著名期刊发表SCI论文百余篇，获重庆市人民政府自然科学奖一等奖2项、二等奖1项、三等奖2项；获重庆市人民政府科技进步奖二等奖2项、三等奖2项。

实验室现有4个博士后流动站、5个博士点、5个硕士点。实验室开建以来，已培养博士毕业生70余名、硕士毕业生220余名，有12名博士后出站；获得市级优秀博士论文12篇、优秀硕士论文15篇。

为了进一步加强交流与合作，扩大国际影响，逐步扩大实验室基地和研究队伍，实验室开始了与美国哈佛大学、美国宾州大学、德国马普生物物理化学研究所、荷兰乌德勒支大学、德国尤利希研究中心、德国乌尔姆大学、美国康奈尔大学、加拿大不列颠哥伦比亚大学、美国大自然保护协会、中科院水生所、长江水产所、万州水产研究所等国内外科研单位在科研、研究生培养等方面的合作。

实验室积极对外开放，加强学术交流。实验室多位成员在国际会议上做大会报告。先后邀请美国哈佛大学Alexander F. Schier教授和Susan Mango教授、法国图卢兹第三大学Sovan教授、美国马里兰大学Thomas D. Kocher教授、Karen Carleton教授，美国麻省大学医学院Nathan D. Lawson教授，英国剑桥大学David Aldridge教授、德国尤里希研究中心（Juelich Research Center）Arnd Kuhn教授、荷兰阿姆斯特丹自由大学Hans Cornelissen教授、捷克南波希米亚大学鱼类养殖与水生生物研究所所长Otomar Linhart教授等多名专家、学者前来进行学术交流。实验室多名成员曾先后赴美国、澳大利亚、日本、加拿大、印度等相关高校或研究机构进行学术访问或做访问学者。

实验室立足三峡库区，利用特有地理优势，培养优秀研究人才，承担国家和地方研究项目。增强与国际、国内各方面的合作与交流，拓宽研究领域，提高科研水平。加强建设，优化管理，接轨国际，完善装备，充分发挥设备和人才优势，努力把本实验室建设成为既能服务于地方经济、社会发展和国家西部大开发，又能进行较高科研创新的国内外一流的重点实验室。