4月12日,生命科学学院第七届研究生学术论坛在29号教学楼2楼学术报告厅顺利举行。美国德克萨斯大学西南医学中心、定量生物医学研究中心的生物统计学、生物信息学和整合生物学的王涛博士为广大师生做了一场题为《Multi-faceted modeling approaches to characterize tumor immunity》的学术报告,生命科学学院党政领导队伍及10余位专家老师出席本次学术论坛。
讲座中,王涛博士主要分享了实验室通过生物信息学分析,结合基因组学,病理学和医学记录数据,提出了一种新型的癌症治疗思路的研究成果。王博士首先介绍了癌症及其微环境,以及处理肿瘤免疫原性和细胞异质性使用的生物信息学和生物统计学方法,他们实验室以肾癌为研究对象,利用肿瘤移植手段将人体肾肿瘤原位移植到小鼠体内来分析肿瘤微环境(TME),同时利用Bayesian Hierarchical模型分析非均质肿瘤,并通过匹配大体积肿瘤、移植肿瘤和正常组织的RNA-Seq分析未知的免疫/基质组分。在定义eTME基因实验中,发现65%以前定义的免疫标记基因在肾细胞癌(RCC)中不大量表达,并且鉴定了610种新的免疫/基质转录物,eTME基因提供了肿瘤与炎症和预后因子的系统表现之间的联系。在此基础上,王博士实验还研究了炎性微环境和炎性巨噬细胞的相关性,发现炎症性肿瘤标记(IS)与全身表现及预后因素相关,与全身炎症表型一致,IS肿瘤患者的生存率较差,肿瘤移植物在鼠宿主中诱导免疫反应与人宿主有些相似。在如何使用基因组学方法检测新抗原的问题上,王博士提到大多数正在进行的关于新抗原的研究都是描述性的,如何找出哪种新抗原具有免疫原性,并将T细胞受体序列与新抗原特异性相关联等是新抗原研究中令人兴奋的新机遇,新抗原特异性TCR-T疗法可能是未来癌症治疗的希望。目前,他们实验室预测新抗原的免疫原性方法有新抗原体内直接建模,包括TCGA,KCP和Sato cohorts,和开发一个强大的模型来处理多实例研究,如果他们的方法成功,可以为新抗原检测提供新的应用。
王涛博士用详实的数据进行分析,为研究如何表征肿瘤免疫力提供了新的思路,为利用其治愈癌症提供理论基础。在提问互动环节,王博士与在场师生积极互动,耐心细致地答疑解惑。王涛博士德才兼备的人格魅力给在场师生留下了深刻印象,同学们纷纷表示收获颇丰。